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DeepMind推出AlphaFold,可通過(guò)氨基酸序列預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)

發(fā)布時(shí)間:2018-12-04 14:53:39來(lái)源:pingwest

  PingWest 品玩 12 月 4 日訊,根據(jù)英國(guó)衛(wèi)報(bào)報(bào)道,周日在墨西哥坎昆舉辦的一場(chǎng)國(guó)際會(huì)議中,DeepMind 的最新 AI——AlphaFold 成功地根據(jù)基因序列預(yù)測(cè)出蛋白質(zhì)的 3D 形狀。

  “蛋白質(zhì)折疊”是一種分子折疊形式。生物由蛋白質(zhì)構(gòu)成,生物體功能由蛋白質(zhì)形狀決定。理解蛋白質(zhì)的折疊方式可以幫助研究人員更好的了解蛋白質(zhì)本身的功能。

  DeepMind 為預(yù)測(cè)“蛋白質(zhì)折疊”開(kāi)發(fā)了 AlphaFold,并以該項(xiàng)目參加了 Critical Assessment of Structure Prediction (CASP)。CASP 是一年兩次的蛋白質(zhì)折疊奧運(yùn)會(huì),吸引了來(lái)自世界各地的研究小組。比賽的目的是根據(jù)氨基酸列表來(lái)預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),這些氨基酸列表會(huì)在幾個(gè)月內(nèi)每隔幾天發(fā)送給參賽團(tuán)隊(duì)。這些蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)最近已經(jīng)通過(guò)傳統(tǒng)方法破解,作為比賽的正確答案。

  盡管是首次參加比賽,AlphaFold 就在 98 名參賽者中名列榜首,準(zhǔn)確地從 43 種蛋白質(zhì)中預(yù)測(cè)出了 25 種蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu)。而同組比賽中獲得第二名的參賽者僅準(zhǔn)確預(yù)測(cè)出了 3 種。值得一提的是,AlphaFold 關(guān)注從零開(kāi)始建模目標(biāo)形狀,并不使用先前已經(jīng)解析的蛋白質(zhì)作為模板。AlphaFold 在預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的物理性質(zhì)上達(dá)到了高度的準(zhǔn)確性,然后基于這些預(yù)測(cè)可以使用兩種不同的方法預(yù)測(cè)構(gòu)建完整的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)。
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